針對今晚復興航空的重大飛安意外，總統府發言人馬瑋國轉述，馬英九總統第一時間得知傷亡狀況，感到非常悲慟，並與行政院長江宜樺通電話，行政院立即成立馬公空難中央災害應變中心，全面釐清事故發生原因、全力搶救傷者，及提供受難者家屬全面的協助。總統也表示，今天是台灣航空史上非常沉痛的一天，全台灣人民同感哀傷。