即將接任衛福部長的薛瑞元，以及接任次長和疫情指揮中心指揮官的王必勝，這樣的人事安排，看在醫界的眼裡，普遍認為在防疫工作銜接上，影響並不大，前疾管局副局長施文儀更坦言，如果不是私德爭議，依照王必勝受重用的程度，原本有望擔任部長​​，至於由次長兼任指揮官，會不會變成「另類的指揮中心降級」，新光醫院副院長洪子仁則認為​，王必勝長期跟陳時中合作，對於疫情掌握、醫療量都很了解，協調各部會並不是問題。

面對立委詢答，衛福部次長薛瑞元不疾不徐的回應，誠懇堅定的態度，也是外界對他一貫的印象，接下來薛瑞元將接棒陳時中，所留下的衛福部長職務，其實過去他一直是陳時中的得力左右手，而他擁有醫師和律師雙執照，加上豐富的公務資歷，也被視為接任的最佳人選，雖然個性親切溫和，但有人認為這既是優點也是缺點。

新光醫院副院長洪子仁說：「對我們整個台灣的醫療衛生的政策的，無縫接軌的延續性，我想是一個非常不錯的選擇。」過去他掌管全台部立醫院，加上多次擔任前進指揮所指揮官，對防疫工作駕輕就熟，甚至有人認為，要不是因為緋聞風波，王必勝也是接任部長的熱門人選，新光醫院副院長洪子仁說：「透過他(王必勝)這兩年來，在指揮中心從頭到尾的參與，我想這是讓指揮中心變動最小的情況下，一個最佳的決策對疫情能夠掌握，又能夠跟整個防疫中心充分配合的人，來擔任指揮官的角色。」

王必勝擔任次長指揮官，這兩年在指揮中心從頭到尾參與，這是變動最小的最佳決策，疫情到現在兩年多了，8月9月收尾也可能考量，指揮中心是否要9月降級，或5類降4類，希望最後有一個對疫情掌握，跟指揮中心配合的人來。

至於外界指出，原本由衛福部長陳時中兼任防疫指揮官，現在改由次長來擔任，會不會讓指揮中心變成另類降級，在跨部會協調上更不容易，對此醫師洪子仁認為，行政院賦予指揮官協調各部會的權力，未來由王必勝接任指揮官，也不是問題。

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