樺加沙颱風來襲，不只沿海風浪明顯增強，在綠島以及小琉球外海，都有民眾目擊，看到水龍捲。它貫穿雲層，而且不斷快速移動，至少維持了十多分鐘。專家指出，水龍捲在環境不穩定等情況下就容易生成。氣象署提醒，隨著颱風西移，東部外海開始出現一波波雲系，不排除未來還有水龍捲出現的可能。

水龍捲直衝天際而且不斷移動，被綠島民眾目擊，既便水龍捲是出現在堤防外還是讓人看了觸目驚心，目擊民眾鄭全德說：「我在巡邏，在人權文化園區巡邏的時候看到，滿驚訝的，滿大的，滿新奇的。」綠島民眾說：「不太對喔，它一直在走。」另一頭也有民宿裡的管家直擊，水龍捲讓附近海面水氣跟著不斷翻騰，整個過程大約十多分鐘，目擊民眾鄭全德說：「看到它霧化，從公館鼻那邊進去，開始就霧化了。」

水龍捲不只出現在綠島附近海域，小琉球外海也有民眾目擊，小琉球水龍捲，大家也很好奇為何在颱風出現前，會有水龍捲現蹤。所謂「水龍捲」，就是在水面上形成的龍捲風，主要有四大生成條件，海面「溫度高」大氣環境「不穩定」，像是颱風就是其中之一，加上垂直風切大以及海面上方有「冷空氣」，就容易形成「水龍捲」。

氣象專家林得恩說：「隨著高度開始作了一些變化以後，它容易有旋轉的過程，結合了以上這四種關鍵的物理機制，就容易產生水龍捲。」如擎天水柱般的水龍捲在台灣並不常見，而且生命週期通常只有幾分鐘，一旦離開海面缺乏能量就會消散，登陸的機會通常不高。

氣象署科長林伯東說：「這些雷達回波似乎有一些曲線的狀況，其實這就是一個在颱風的外圍雲系，可能會有帶有一些類似像『颮線』這樣的性質，所以其實在這些小小的對流胞裡面，可能都帶有一些渦漩，甚至可能會有一些水龍捲，會出現在海面上。」

氣象署觀察，不排除這回海面上還會持續有出現水龍捲的機會，各地沿岸的驚濤駭浪，已經可以明顯感受到颱風的威脅，時刻提醒著大家樺加沙威力不容小覷。