台鐵太魯閣號出軌事故造成重大死傷，施工單位「東新營造」及監工單位，都遭檢調調查，就連廉政署都介入追查，要釐清是否有弊案，而肇事的義祥工程負責人李義祥，疑似借牌轉包涉及圍標，相關人等都被檢調漏夜問訊，最後承包商「楊金郎」5萬交保，監工「林長清」違反政府採購法300萬交保，另外，東興營造負責人黃平和跟兒子黃文利，也因為違反政府採購法，各別以500萬和25萬交保，但黃平和到清晨6點，家人只湊到400萬，檢方裁定讓他先行交保離開。

是不是借牌標案，李義祥低著頭沒有回答，工程車滑落，釀成太魯閣號出軌，造成重大死傷悲劇，檢調深入追查，借提李義祥訊問，要釐清有沒有其他隱情，還有李義祥雇用的逃逸外勞阿好，也被帶回調查，躲了六天，最後還是被抓到。而且兩人都因為涉嫌過失致死罪嫌，可能有串證滅證之虞，兩人都被裁定羈押禁見。

而其他檢調要追查的，就是跟工程有相關的人員，包括東新營造負責人黃平和，在廉政署人員攙扶下，拄著柺杖到案說明，他疑似涉嫌借牌轉包，讓不符合資格的李義祥能參與工程，還有李義祥的工地夥伴，也是東新營造的監工，綽號黑猴的林長清也被帶回複訊。

東新營造過去多次取得台鐵高額標案，總金額達到4億4千萬，廉政署調查局都要介入釐清，他們懷疑標案中藏有弊端，還有承包商楊金郎，也被地檢署漏夜偵訊，他疑似沒有專業執照，卻擔任專任工程人員，有業物登載不實的情形，最後檢方做出裁定。

承包商楊金郎涉嫌業務登載不實5萬交保，東新營造監工林長清(黑猴)違反採購法，300萬元交保，東新營造負責人黃平和違反政府採購法，400萬元交保，黃平和兒子違反政府採購法，25萬元交保。花蓮地檢主任檢察官周芳怡說：「李姓被告是不是，要到現場模擬的這件事情，那我們都會依照，我們的偵辦進度，如果有必要的話，我們不排除會讓他到現場來模擬。」太魯閣號出軌事故，顯示出不只安全管理有問題，就連是否有弊案都不能排除，檢調表示會擴大持續追查，要把相關負責單位一一查清。