目前在澎湖海面，已經發現了八十多具罹難者遺體。法醫也開始驗屍的工作，其實驗屍工作，也有助於釐清失事原因。因為從座位分佈圖來看，大部分遺體完整的乘客，幾乎都坐在飛機的前半段，專家說：「這顯示飛機的爆裂點，很可能是在飛機尾端」。　　 一走進停屍間，看到親人遺體，家屬情緒完全崩潰空難家屬從大海中打撈上來的罹難者遺體，陸陸陸續被送到空軍馬公基地存放，等待家屬來確認身分，法醫也開始了驗屍的工作。部分遺體已經完全無法辨識，刑事局鑑識人員，將根據指紋，齒模以及採集親屬的DNA來做進一步的比對。 　　而遺體完整的罹難者，包括最早被打撈上岸的乘客，座位在28排J的朱志民，幾乎都是坐在飛機的前半段，這顯示飛機在空中解體時的爆裂點，應該在飛機尾端。法醫透露一則重要的訊息，罹難者的遺體，幾乎都有一個共同點，就是乘客遺體的下巴和下顎都有骨折現象。　 法醫依照空中逃生程序，發生緊急狀況時，空服員應該要指示乘客，將安全帶繫好，並且把頭部盡量壓低，不過，從這些罹難者受傷的部位來看，當時，意外來的太突然，乘客根本是在毫無準備的情況下罹難的。