週日晚間林佳龍在臉書表示，已向總統和行政院長請辭，會在搶救的工作暫告一段落之際，不戀棧職位、負起完全責任，辭去交通部長一職，一早林佳龍再度到事故現場視察，隨後面對媒體鏡頭說明，另一頭，國民黨立委更要求行政院長蘇貞昌一起下台負責。

前一天晚間在臉書上表示，會在搶救工作暫告一段落之際，辭去交通部長一職的林佳龍，上午九點多再到太魯閣號事故現場，交通部長林佳龍說：「我已經請辭那負責任，除了負政治的責任，也負能夠善後的責任。」

而在離開交通部長職位前，是否會任命懸缺至今的台鐵局長，交通部長林佳龍說：「我已經是請辭中那我已經負起責任，有關人事的部分我們會尊重就是，就是新的人事安排。」

而大家對工程標案的疑問，也接踵而來，交通部長林佳龍VS.記者說：「(蔡玉真在臉書上質疑說這家公司的)，(專業人才掛零為什麼聯合大地還有辦法)，(拿到上百個政府的工程標案)，這些我都已經請我們同仁，一定要配合調查。」

檢察官和運安會正在調查，交通部也會進行行政檢討，國民黨團將在週三的交通委員會，提出成立調閱小組調查，立委(國)洪孟楷說：「李義祥以外還有多名的工人在現場，我們合理的懷疑當天根本不是一個人，開著工程車到現場檢視工地那麼簡單，根本就是有預謀的要去現場趕班加工。」

而2018年普悠瑪事件後，說要成立的台鐵總體檢專案小組，現在沒運作，立委(國)鄭麗文說：「上一次就說台鐵要砍掉重練了，為什麼沒有人砍沒有人練，敗選賴清德負起政治責任下台重新組閣，新上任的蘇貞昌院長從此不聞不問。」國民黨團要求蘇貞昌一起下台負責。