農委會推出台灣豬標章，但商家該如何用？民眾如何辨識？開放半個月，仍舊有不少亂象，有立委炮轟農委會，把標章管理責任推給商家，台灣豬標章應該貼在農委會主委陳吉仲頭上，一早陳吉仲南下到台南將軍北門視察寒害，也對這個議題，做出回應。

農委會主委陳吉仲說：「從今天開始，我們讓所有的台灣豬標章的管理審核的機制，回到農委會畜牧處來處理，那我們還是要透過畜產會來協助執行到位，我想現在開始絕對不會造成任何的所謂的，貼台灣豬標章裡面的困擾，但是很高興的是，很多業者來申請台灣豬標章以後，它把進口的豬肉改為國產豬肉，這個就是我們當初設定的目標，所以我還是要再次地強調這個方向是正確的，那執行面如果有不夠周全的我們很樂意檢討。」

農委會為了方便民眾辨識豬肉來源，以台灣豬標章，作為百分百使用國產豬證明。但近期陸續有知名業者，因為沒有全部使用國產豬而退回標章，有立委痛批，農委會沒有徹底檢討台灣豬標章的問題在哪，也不重新檢視標章管理問題，等於把責任都推給店家。

對此，農委會主委陳吉仲南下視察寒害時回應，台灣豬標章的政策方向是正確的，但執行面有不周全的地方，會持續地檢討並且加強改進。