萊豬進口大戰告一段落之後，國民黨執政縣市再把茅頭對向農委會，雲林縣長張麗善率先開嗆資源太偏袒，更把農委會主委陳吉仲，形容是民進黨立委辦公室主任，淪為輔選工具，陳吉仲澄清，農業不分藍綠。

農業大縣雲林縣縣長張麗善，對準農委會主委陳吉仲開砲，批評農委會已經淪為民進黨立委的輔選工具，更說主委陳吉仲成了綠營立委辦公室主任，張麗善上平面媒體專訪時舉例，像是西螺果菜市場改善案，縣府提了2億預算給農委會，一直沒下文，去年底陳吉仲跟著劉建國去西螺，就宣布要給西螺鎮公所1.5億元來改善。另外也對行政院去年底宣布，要在嘉義朴子投入20億，建新式的屠宰場，大喊不公平，因為雲林的屠宰業是嘉義的好幾倍，想升級屠宰場，卻遲遲盼不到中央幫忙，雲林縣長張麗善說：「我希望中央，不要把雲林縣當做絕緣體，我不是叫戰我是訴苦。」

陳吉仲一早在立法院面對鏡頭強力澄清，農業不分藍綠，農委會主委陳吉仲VS.記者說：「只要有提出正面的，我們絕對會全力來協助，(為什麼會有承諾1.5億的部分呢)，所以我說這一個是所謂的這樣一個，不實的這樣的一個消息。」，陳吉仲說農業完全不受政治影響，也舉出像是針對宜蘭台中南投，等藍營執政縣市的補助，政府都在做，只是張麗善大喊希望能得到中央關愛的眼神，如何讓張縣長真的有感，陳吉仲恐怕得動動腦筋。