迎接民國九十八年，一早總統府前元旦升旗典禮，馬總統元旦祝詞，呼籲新的一年朝野共同救經濟，企業挺勞工不要裁員。意外小插曲是學運團體野草莓跑來抗議。

　　民眾結伴相迎二○○九的第一天，野草莓破管制進到升旗區，手拿陳雲林肖像表達抗議，安全人員雖然沒有制止，卻是緊盯深怕鬧場擴大。現場一位阿伯還和學生嗆聲，
馬總統帶領府院黨高層與文武百官，隔著人牆在特區沒有受到影響，每個人掛上繡有二○○九的國旗圍巾，高唱國歌。

　　馬總統放開喉嚨高唱，情緒有些許激動，升旗時右手舉起行軍禮，注視國旗冉冉上升，面對執政之後，經濟、民生問題嚴重，元旦祝詞以搶救經濟為主軸，馬總統還要公務員走出辦公室，像菩薩一樣苦民所苦。

　　迎接二○○九面對嚴峻考驗，馬總統企盼一切萬象更新，民眾則是希望有好未來。(記者尹順和 羅孝宇 郭鎧 薛松乾 陳苗生報導)