馬英九遭到查黑中心傳訊，也讓【首長特別費】再度引發外界好奇，到底什麼是特別費？簡單來說，各級機關首長，都有一筆經費，專門用於婚喪喜慶、白帖，宴請外賓，獎勵員工。其中一半需要單據核銷，另一半則不需要，俗稱【首長特支費】。

　　凡是首長對外公關，包括白帖，宴請外賓，致贈禮品，只要是公務需要，這些費用都可以由首長特別費支應，依照政府法令規定，特別費是機關因公所需，招待餽贈，工作活動費，及招待外賓費用，簡單說，是首長應付雜項開銷的特別費，俗稱特支費。
　　
　　最關鍵的，就是特別費的核銷方式很特別，一半要憑證一半不需要，以台北市長馬英九為例，每月三十四萬特別費，十七萬需要發票收據或證明文件，另一半則以領據核銷即可，只要能證明錢是誰領走，方便日後追查，就屬合法，高雄市長特別費與台北市大致相同，行政院長特別費比較少，一個月將近十六萬，核銷方式各級首長是一致的，並沒有大差異，只是錢多錢少而已。
　　
　　特別費一向被視為首長個人小金庫，只要與工作有關，可以靈活運用，只是在國務機要費，與馬英特別費風暴中，遭到外界批評公費變私用，到底公私如何明確劃分，特別費如何用的安心，就看這次約談馬英九，檢調如何界定。