為了不讓特別費風暴持續擴大，台北市長馬英九宣布捐出在市長任內近八年來每個月十七萬，不需要單據核銷的特別費，共計一千五百萬元，來証明他絕不貪財，同時馬英九也表示，目前台北市長的特別費已經規定都得要檢具單據，才能報銷。

特別費風暴纏身，台北市長馬英九不管走到哪裡，都被媒體追問有關特別費的問題，而馬英九除了決定捐出一千五百萬元，證明他不貪財之外，也說明捐款絕對不是為了脫產。至於對行政院決定，從明年一月一號開始，將要求的所有首長特別費支出，都要檢附發票或收據才能報銷，馬英九也回應表示贊成，而且現在已經開始落實。

面對爭議，馬英九只能一再自清，但特別費疑雲還是在政壇持續延燒，民進黨立委頻頻質疑報帳內容，讓市府團隊在任期最後，還得忙於回應相關問題。