就在國務機要費風暴後，高檢署又有大動作，針對台北市長馬英九，遭檢舉首長特別費涉及不法，決定將在十四號以關係人身分，約談馬英九釐清疑點，馬英九表示，將會配合調查。

　　國父誕辰紀念日，馬英九一大早以國民黨主席身分，率領黨務主管，與台北市長候選人郝龍斌，到國父紀念館致意，面對查黑中心，已經發出傳票，將在十四號展開約談，要求說明首長特別費使用爭議，馬英九表示他會配合調查。馬英九表示將完全配合檢調，根據了解，今年八月民進黨立委，檢舉馬英九以特別費認養流浪狗馬小九，高度懷疑公費變私用，要求檢調出面調查，以馬英九每月三十四萬首長特別費，一半需要單據憑證，另一半則不需要，只要領據即可，檢調這次鎖定不需要單據部分，調查特別費匯入私人帳戶是否合法？領據是否不全？有無將特別費作為私用？要求馬英九親自說清楚，釐清爭議。