「科技部新建研究船名稱徵選活動」自106年11月1日開始公告，11月30日截止收件，共收到155份申請書。科技部表示，邀請了10位審查委員組成評審委員會，審查委員專長包含海洋科學/工程、科普教育、媒體傳播/設計、人文(中文、英文、歷史)等領域。審查委員從155件申請案中初審推薦共36案進入複審會議，複審結果推薦3案進入決審，最後通過採用「新海研一號」、「新海研二號」及「新海研三號」。 科技部列出3點解釋，第一，與新船建造案「海研一二三號汰舊換新」精神名實相符，並與舊研究船船名類似，有傳承意義。第二，國際和國內各界皆對原命名相當熟稔並已建立口碑，文字正向、好唸、易記、與海洋科學研究任務直接連結。第三，在實務上，此命名對探測航次的編碼較簡易且能與歷史資料庫銜接。 對此一名網友在PTT「八掛板」po文表示：「花錢跟人力舉辦命名活動，出來的結果卻是這種名稱，真的很棒，很有感，海研元年大啟動！」其他網友也留言表示：「下一次要換什麼 改・海研一號 超・海研一號 極・海研一號」、「新海誠、新海橋」、「那何必辦徵名?」、「這樣搞這些人都沒事？？上班這樣搞還不被定飛」等等。(海研一號網站)