日本放送協會NHK，引述海上保安廳官員說法，指受傷的海保機長表示，他以為獲得了塔台航管人員的「起飛許可」，所以滑行進入C跑道。

海上保安廳官員透露，檢驗對話後發現，航管人員允許日航客機降落，並指示海上保安廳飛機「前往進入跑道之前的地點」等候；但海上保安廳機長在事故後的說法是，他獲得了起飛許可，顯然對話和理解上有落差。日本運輸安全委員會，已派6名專責人員到場，3日上午開始全面啟動調查。剛收到最新消息，海保廳機上兩個黑盒子已經尋獲，將進一步分析內容、釐清肇事原因。