有民眾發文，說自己先前向內政部國土管理署申請第一期租金補貼成功，領到約2萬8千元的租屋補貼，但去年申請第二期時，卻被通知她的房東逃漏稅，不只申請補助失敗，竟然還要她繳回溢領的租屋補貼，不滿為何房東逃稅竟是房客要承擔。對此，國土署表示，檢核不合格者，雖然已經核撥款項，但確實未符合規定，必須返還補助金。不過申請戶可提起訴願、行政訴訟等管道維護權益。

有民眾發文，說先前申請第一期租屋補助成功，當時領到租金補貼約2萬8千元，2023年申請第二期租屋補助時，卻被通知「房東逃漏稅」，不只申請失敗，還被國土署要求，退還溢領的補貼金，當事人不滿房東逃稅，竟然要房客承擔，崔媽媽基金會法務組長曹筱筠說：「當時300億租金補貼回到中央去做審查，那在審查過程當中，當然他們是希望能夠，他們的說法是能夠便民能快速通關，所以說他們在審核上面，似乎就少了一些比較謹慎的部分，發完補貼之後，才發現到他們審核是有錯誤的。」

從發函公文來看，「租賃房屋未具備房屋稅籍編號與規定不符」，指的就是當事人承租的是「未申報違建」，國土署強調，依照現行規定，房客仍必須退還溢領的補貼金，但可以申請救濟，崔媽媽基金會法務組長曹筱筠說：「目前來講的話，他們的處理模式是希望民眾能夠，將溢領的錢還是跟他們討論一下，怎麼樣去返還這筆款項，採用一個比較長期性的分期，如果你(房客)不討論去做返還的話，你是沒辦法申請今年度的補助的。」

還而新一波租金查稅即將展開，國稅局預計將針對學校捷運周邊等出租熱區，展開為期2年的查核，初步預定調查8000件，呼籲房東房客按規定配合，否則可能得負相關民事責任。