在搜救的進程方面，目前有七十艘軍艦，透過照明彈在海上救援。而為了掌握七十二小時的黃金搜救時效，上百艘各式艦艇漁船，已經全部出動，可惜到目前為止，還沒有發現生還者。國防部表示，搜救行動不會只侷限七十二小時，將會一直持續找到絕大多數的失蹤者。 　　上百名刑事局以及調查局鑑識人員，在空難發生以後立即趕到澎湖，成立臨時DNA檢驗站，許多焦急的家屬在沒辦法確認罹難親人遺體的情況下，都先來這裡抽血，建立指紋檔案，大家的心情都很沈重，只希望盡快透過科學方式，來確認親人下落。而搜尋人員把握時間，分秒必爭，因為有的檢體在海水裡面泡太久，會增加DNA檢驗的困難度。 　　目前刑事局和調查局通力合作，投入相關所有人力，來進行DNA檢驗，而化驗一批檢體的時間，大約需要24小時，除了在澎湖，有鑑識人員在現場服務以外，調查局也在台北縣新店，增設家屬抽血站，來協助家屬進行比對。