從這架華航班機，在雷達上消失後，國軍就立刻展開了海空搜救。入夜後，空軍更派出了C-130運輸機，連夜在空中發射照明彈，方便搜救工作的進行。空軍搜救直升機，以及海巡空中偵查對的直升機，連夜載馬公機場起飛，到澎湖目斗嶼海域一帶進行夜間搜救的任務。 　　直升機的雷達銀幕上，顯示出船隻在海上的動態，包括海巡署船隻，軍方船艦，以及澎湖地區支援加入救難的漁船，海面到處可以看到船的燈火閃爍。畫面上看到的就是海巡署的船隻，正放出探照燈觀看海面的情形，但是到了夜晚能見度實在太差，探照燈的能見度有限，要找到罹難者，甚至是可能的生還者都相當的困難。 　　直升機也從飛機上打出探照燈，搜尋海面的狀況，海巡署船隻也跟著射出照明彈照亮夜空，希望能有一絲絲的希望。搜救人員表示，海面溫度很低，即使有生還者要對抗低溫還是很難，但是搜救任務會持續進行。夜間的海面看似平靜，但是也有四五級的波浪，要生還機會渺茫，這是一場跟死神拔河的救災任務。