食藥署先前風波不斷，從最近輸液缺貨，到更早之前蘇丹紅辣椒粉、缺藥潮，新冠疫情期間黑心快篩事件等等，都是食藥署長吳秀梅在任期間爆出的爭議。她被外界認為嚴重失職，近期傳出吳秀梅因此遭到拔官，將在6月底卸任。傳出接棒的新任署長，是中國醫藥大學藥學院院長莊聲宏，行政院長卓榮泰今(28)日也進一步證實，並表示尊重衛福部規劃。

食藥署署長吳秀梅(2024.02)說：「各位媒體女士先生大家早安。」食藥署署長吳秀梅在位超過7年，前後經歷過四任衛福部長，是目前任期最長的食藥署長，但近期卻驚傳「被拔官」，7月1日前即將卸任，藥師公會全聯會理事長黃金舜說：「邱泰源部長擔任立委的時間，為了再生醫療法，跟吳秀梅署長有很大的意見不同，所以衝突滿嚴重的，會換人對我來講是意料中的事。」

邱泰源部長擔任立委的時間，為了再生醫療法，跟吳秀梅署長有很大的意見不同，所以衝突滿嚴重的，會換人對我來講是意料中的事，外界猜測無非就是因為，吳秀梅在任期間爭議連環爆，先是最近的輸液缺貨寶林案風波，蘇丹紅辣椒粉台糖豬含西布特羅，去年美豬標示毒莓果事件缺藥潮，以及新冠疫情期間，爆出黑心快篩高端疫苗爭議等等，處理不當被認為嚴重失職。

行政院長卓榮泰說：「衛福部有整套的人事新的規劃我們尊重，那也希望新的署長，也是一樣的積極負起這樣的責任，那也希望吳署長在未來任何工作崗位上，為國家繼續提出更多的政策建言。」

至於下一位接棒的新任署長，盛傳是這一位學者莊聲宏，現職為中國醫藥大學藥學院院長，曾在國外取得相關科系博士學位，專業領域包含，新藥開發基因治療分子技術等等，具有一定的藥學專業背景，中醫大相當低調不多做回應，但藥師公會已經間接證實，藥師公會全聯會理事長黃金舜說：「我也在電話中跟他(莊聲宏)祝賀跟他恭喜，莊署長跟我過去有十幾年的互動，對事情的負責度都是相當的優秀。」

藥界也認為，過往食藥署長卸任都是食安風波導致，未來署長最大挑戰，得嚴密把關食安解決缺藥危機，才足夠勝任這個職位。