國安特勤夾帶大量免稅菸案爆發第四天，總統蔡英文今(25)日首度公開露面，針對這起案件，蔡總統表示，即使是陳年陋習也必須了解原因，不容再發生。她要求相關權責單位在一週內提出檢討報告。蔡總統表示，他已經下令新任國安局長邱國正進行整合、整頓國安系統，至於在野黨傳出要求總統府祕書長陳菊下台的呼聲，總統呼籲在野黨不要橫生枝節。