台北市長柯文哲連任成功，許多議員選後第一槍瞄準北農總經理吳音寧，不滿有年薪250萬的高級實習生存在，議員主張修法，讓北農吳音寧到議會備詢，台北市長柯文哲上午回應，他對吳音寧不去議會很不滿，因為換自己變砲灰，農委會主委林聰賢更表示，吳音寧的階段性任務應該已經完成，似乎暗示吳音寧去職已成定局。 九合一選舉民進黨挫敗，面對內閣改組，農委會也被點名，更表示北農總經理吳音寧，已完成接段性任務，林聰賢表示農委會會配合台北市政府的節奏來走。 就盼終結「吳音寧亂象」，許多議員主張修法，將原本北市府投資事業管理監督自治條例規定，市府資本額未超過50%，由市府股權代表列席議會報告，而市府占北農公司資本額只有22%，因此議員希望將比率由50%下修到20%，這樣北農總經理就得到議會備詢。 如今連決定北農總經理人選的農委會，都表示吳音寧的階段性任務應該已經完成，似乎也暗示吳音寧去職成定局。