這次九合一大選綁公投，就有公民團體觀察檢視這次公投過程的優劣，由於是修法後首次，提案又多，加上綁九合一選舉，不但投票與開票時間延宕，甚至還容許當天宣導公投，有許多地方需要改進！ 這回九合一大選綁公投，十案有七案過關，不過過程中，公民團體認為有諸多瑕疵需要改進，而且這回在公投案中，有五案是同性相關議題，內容不仔細看非常類似容易讓人混淆，下回應合併為一個公投案，另外在投票日當天，也應比照選罷法，禁止在投票所附近宣導公投，預估兩年後總統大選，還有機會再舉辦公投，政府應重新檢討要一次辦得比一次好。