另外就是橫向國道要不要收費呢？雖然還沒有地案，但是南投縣長林明溱先跳出來強力反對，認為應該要免費，不過民眾的看法則不一定，也有人認為使用者付費很合理。 交通部長賀陳旦提出"使用者付費"的想法，研擬未來橫向國道也要開始收費，雖還沒定案，已經引發各界關注。而國道六號可能是第一個橫向國道收費實施地點南投縣長林明溱則跳出來反對，南投居民則是反應兩極化，為了貫徹使用者付費，新任交通部長賀陳旦拋出橫向國道也要開始收費的議題，首當其衝的包括南投的國道六號，雖然還沒定案，縣長林明溱搶先表達反對立場，縣長認為國道六號是往來南投和埔里之間重要幹道，南投民眾用的最多，不應該加重南投人的負擔，不過也有南投民眾，認為使用者付費的觀念沒有錯，南投民眾反應兩極，另外也可能必須收費的。