國民黨在總統大選失利後，行政院長毛治國立即宣布請辭。毛說「對於引發的困擾感到抱歉，但請辭的決定不會有任何改變」，決定自上週六請辭開始，即不支領薪水。 毛治國並在聲明中表示，有關外界關切本議題的焦點，不應該集中在個人去留或留住一個院長的問題，而是必須面對：短期內政務推動陷入空轉的嚴肅處境以及如何建立可長可久的憲政慣例。另一個重點是，協助代表新民意的政府順利接軌。 他還說「短期而言，面對國內外嚴峻的經濟情勢，如何避免國家空轉4個月已是迫在眉睫的重大課題，朝野各界都不應迴避。長期而言，有必要在符合責任政治的精神下，建立由多數黨組閣的憲政慣例，國家方能長治久安」。