大選過後，國民黨大敗，行政院長毛治國宣布請辭，2月1號，新立委就要上任，但新任總統得等到５２０才就職，在新舊任總統交接前的空窗期長達123天，即將卸任的馬政府無法再推任何施政，國家運作恐怕將陷入空轉，選前馬總統丟出選後可由多數黨組閣，蔡英文是不是要接受？不接受又要如何跟馬政府進行無縫交接，成為選後馬上得面對的問題。 蔡英文宣布當選後，2月1號新任立委就職，行政院總辭，但5月20號新任總統才就職，中間有三個月多的空窗期，變成燙手山芋，馬政府內閣變成看守，憲政可能全面停擺，哪些隱憂，其實2012總統立委合併選舉，就曾出現類似情形，當時馬總統順利連任，沒有新舊民意的困擾，這次大位換人，新總統與卸任總統，空窗期間的政務運作，會不會出現兩個太陽？怎麼辦會碰面協商嗎？專家提出意見，也可以參考國外做法，蔡英文當選，但規範空窗期的交接條例還沒出爐，選民在乎的不只是誰當選，更希望和自身相關的政務，可千萬別被耽誤。