由法務部、外交部跟刑事警察局等單位組成的調查團一行17人，今天飛抵菲律賓馬尼拉，要針對「廣大興28號」事件，進行實地調查，但是菲律賓總統府發言人在例行記者會上，卻對台灣調查團獲准前來聯合調查的事情，表示並不知情，而且司法部門也拒絕台灣方面直接參與的聯合調查。 　　早在5月15號，外交部跟菲律賓代表白熙禮，進行緊急磋商時，就明確傳達台灣調查團在16號前往馬尼拉，但菲律賓政府卻表示毫不知情，讓外界相當意外，這是因為雙方溝通不良，還是菲律賓的外交策略，耐人尋味。 　　而且菲律賓司法部長德利馬表示，台灣調查團不可能直接參與事件的調查工作，菲律賓有自己的調查過程跟司法系統，不會同意台灣調查團進行聯合調查，也不希望任何人干涉菲律賓的調查工作，台灣調查團必須透過合適的管道，提交正式的申請。