立委邱毅指控，民進黨主席蔡英文在擔任行政院副院長任內，積極推動生技新藥產業發展條例，並且以國發基金、投資台懋創投和宇昌生技超過10億元，在卸任後，蔡英文，還擔任這兩家公司的董事長，邱毅質疑，蔡英文把國發基金當成自己的小金庫。 　　立委邱毅再咬蔡英文，在擔任副閣揆任內，專案通過國發基金投資宇昌生技，卸任後隨即擔任與昌生技董事長，自肥超過6億元，根據經建會資料，2007年2月蔡英文擔任行政院副院長，當時的行政院專案通過，國發基金投資宇昌以及台懋兩家生技公司，跳過國發基金審議程序。 　　5月21日蔡英文卸任九月就擔任宇昌生技董座，誇張的是宇昌九月五日才登記成立，國發基金兩天前就撥款4000萬到宇昌的帳戶，法案量身訂做，國發基金投資成了小金庫，邱毅預言，蔡英文涉及自肥，還有更勁爆內容。