前總統李登輝，因為國安密帳案被起訴了，其實在2002年扁案爆發後，外界就曾經將矛頭指向李登輝，但當年他只被列為證人，沒想到2008年，陳水扁趁著海外洗錢案出庭時，當場檢舉李登輝。 　　陳水扁帶著洗錢防治中心做的報告，跟檢察官告發，他說李登輝在執政後期，有將近10億的國安密帳，被匯到新加坡等國家，還拿錢去蓋臺綜院，也因為後來爆發了扁案，陳水扁為了自保，乾脆把曾經情同父子的李登輝供了出來。