針對台中市與高雄市都表明，升格五都後沒有意願接手管理國立高中職，教育部表示，這已經不是教育部能夠解決的事，得由行政院進行協調。 　　

教育部次長林聰明說，這件事情牽涉到財政收支劃分法，己不是教育部層級可以解決，不過己經組成專案小組了解情況，但當立委問到，萬一民國101年時，這些學校還是拒絕被併入怎麼辦？教育部只說會再多進行協調與溝通。