對於內閣總辭，朝野立委都肯定劉兆玄負起政治責任，但是對於內定的行政院長人選-吳敦義，有立委表示很意外，民進黨立委擔心他從國民黨黨職轉換為行政首長，未來施政是否會有黨派之分，也有國民黨立委認為，吳敦義過去曾經擔任高雄市長，但畢竟沒有中央首長經驗，而他面對的首要挑戰就是組閣，一定要用對人才。