為審慎因應莫拉克颱風可能帶來災害，莫拉克颱風中央災害應變中心於8月5日晚間8時30分中央氣象局發布海上颱風警報後成立2級開設，6日上午8時30分海上陸上颱風警報發布後提升為1級開設，動員國防部等21個單位進駐。