2004年總統大選，對軍情局而言，日子既煎熬又漫長。2003年11月30日，陳總統為求勝選連任，推動飛彈公投，首次公布中共496枚飛彈部署位置與數量，還特別強調來源是「情資」；中共則近乎賭氣，隨即報復性地從十二月中旬到隔年元月，一口氣抓了三十多名台諜。這批台諜大多是台商，成為兩岸情報較勁的代罪羔羊。