這次偵辦馬英九首長特別費的，就是查黑中心檢察官侯寬仁，他過去辦過太極門養小鬼案，還因為周人蔘電玩弊案，被人寄子彈恐嚇，聲名大噪。侯寬仁再婚時，當時擔任法務部長的馬英九曾經上台致詞，如今換成他辦老長官，讓首長特別費的偵辦，更受到外界關注。

　　檢察官侯寬仁帶著大批人馬，搜索太極門南港道場，這是侯寬仁在民國八十五年，所偵辦的太極門疑似詐財案件。一句小鬼附身，讓侯寬仁成了爭議性人物，不過他根據受害者的檢舉，認為養小鬼的說法可受公評，還將養小鬼寫入起訴書中，成為司法首例。

　　而侯寬仁辦過的著名案件，還包括民國八十一年健康幼稚園火燒車事件，以及八十三年間桃園議長選舉，一口氣起訴二十二名議員，八十五年的周人蔘電玩弊案，更有超過四十人被起訴，其中還包括檢察官及高階警官，侯寬仁還因此收到恐嚇子彈；前年的勁永禿鷹案，侯寬仁更直接槓上金管會金檢局長李進誠。

　　而這一回，侯寬仁承辦首長特別費的案件，又再度成為焦點，因為馬英九在擔任法務部長期間，曾經替侯寬仁證婚致詞，如今換成侯寬仁來辦老長官，也讓馬英九首長特別費的偵辦，備受關切。