面對保釣運動再起，立刻挑動敏感台日關係，外交部立刻出面重申，釣魚台主權立場，並通知海巡署注意保釣人士出海安全，日本在台官方機構，日本交流協會，則不願對這起保釣事件多做回應，不過交流協會外頭，是出現民眾抗議場面，與警方對峙。

　　抗議群眾一出現，大批警力，由警政署外事警察與轄區警方，立刻擺出陣勢，避免日本交流協會遭到群眾攻擊，就在日本戰敗61週年，小泉首相參拜靖國神社，引發亞洲國家強烈抗議，台灣保釣團體選在此刻，出海宣示主權，日本駐台官方，低調不回應。高原靖國神社與保釣運動敏感話題，一律不談，避免挑動台日關係敏感神經。

而外交部也在獲知保釣團體出海後，發表正式聲明，強調釣魚台主權。將保釣團體，認定是愛國行動，外交部也委託海巡署，密集監控保釣人士最新動態，確保安全，萬一與日方發生海上衝突，外交部也將透過駐外管道，將傷害降到最低。