配合國軍精實案，金門馬祖和澎湖外島將再度大幅裁減駐軍，預計民國九十七年，三處的總兵力將降到一萬多人。國防部強調這是國防部既定的政策，不過朝野意見分歧，多數立委表示支持，但是馬祖立委則反對，認為裁減駐軍會威脅到居民的安全。