針對這場集會活動，陳水扁總統透過總統府發言人黃志芳，也發表三點聲明，重申同意行政驗票，支持[獨立鑑識小組]，來協助偵辦槍擊案，同時也強調，啟動國安機制的影響層面，並沒有外界想像的那麼大。 　　就在三二七集會前的半個小時，陳水扁總統透過公共事務室發言人黃志芳發表聲明，重申支持行政驗票。對於槍擊案件的調查也歡迎國際專家成立獨立調查小組至於在野黨一再質疑啟動國安機制，陳總統也提出他的看法。另外，陳總統的聲明也指出他曾經敗選過兩次，充分了解集會民眾的心情，希望所有人都能冷靜、理性。