陸委會上午八點半，緊急召集內政部、國防部及總國安局，以及海基會等相關單位會商，討論如何處理涉嫌海盜船的大陸船問題。經過兩個小時的討論，陸委會決定暫時不公開船員的筆錄，先由主管機關了解真相後，再由台中港役所，將全案移送台中地檢署偵辦。 　　陸委會副主委馬英九表示，陸委會將慎重處理本案，以便作為兩岸今後共同打擊犯罪的範例。協調會報決定，將等司法偵結後，再決定是否讓十八名中國漁民先服刑還是先遣返。 　　協調會報認為，大陸漁船涉嫌作案的地點，應該視同在我國領域上犯罪；涉案的十八名中國人員將暫時住在台中靖廬，漁船都由港局所看管。陸委會將委託海基會盡快和大陸方面聯繫，此外陸委會也對漁民協助打擊犯罪表示肯定。