公投投票，各地陸續也出現一些狀況，像在台中和新竹，都發生有民眾疑似投錯票後，想將選票帶回家，甚至是當場撕毀選票的情況，結果都被員警帶回警局偵辦，彰化則是有婦人投票時太緊張，突然昏倒，還有一名男子檢舉，現場的民防要他投下不同意票，驚動了員警和警察分局長到場，另外在台東，則是有選民沒收到投票通知單，還有台中的男子在進入圈票處時，才發現自己竟然少了一張選票。

男子掀開圈票處的簾子，並不是他已經投完票了，而是發現自己少了一張公投選票，監選人員VS.投票男子說：「少一張耶少什麼顏色的。」在場的監選員雖然立刻補給他，但討論了一下，又再上前檢查男子的口袋，要確定他身上沒有多餘的選票，公投日各地陸續發生狀況，同樣在台中，竟然還有民眾當場將選票撕毀，台中東區分駐所長張竣詒說：「婦人自稱喔他蓋錯了兩份公投票，因而將選票撕毀。」

類似的情況也發生在新竹，分別有兩名女子投錯票，結果一人將選票撕毀，一人想將選票帶回家，被發現後都被帶回警局，另外在彰化，則是有婦人投票時太緊張，結果當場昏倒，彰化消防隊員蘇美嘉說：「她的章無法蓋完全，那她怕她的票導致它是廢票，所以情緒很激動發生了就是暈動。」還好婦人立刻甦醒，沒有生命危險。

同樣是在彰化，延和活動中心的投開票所，還出現了10幾名員警，連當地警分局長都到場，因為有一名男子檢舉，在場的民防人員竟然要他投下不同意票，彰化分局分局長王國峯說：「在旁選務人員確認，沒有聽到這位民防義警有跟民眾，有這樣的指示或勸誘，那選監委員隨即裁示喔，這個檢舉案是不成立的。」

還有在台東的林小姐抱怨，自己一家人和附近很多里民，竟然都沒有收到投票通知單，當事者林小姐說：「不接受他道歉，因為這個我們選舉是常有的事情，而且這個也是一個國家的重要政策。」事後里長解釋，疑似是協助發送通知單鄰長的家中有一名失智長輩，將通知單撕毀，但林小姐無法接受這樣的理由，不過還好就算沒有通知單，只要憑著身分證和印章，仍然可以進行投票。