中研院女研究助理，確認染疫後曾透露，在實驗時兩度遭到老鼠咬傷，也一度讓感染源頭指向老鼠，但台北市長柯文哲相當不認同，他說有2億5千萬分之3的機率，真的非常低！而面對P3實驗室的SOP和安全性遭到質疑，柯文哲也怒批，中研院欠缺教育訓練，直指實驗室的SOP有疏漏，相當嚴重，中研院坦承，女研究助理第一時間有按照SOP通報實驗室主管，但卻在第一關就斷鏈了！沒有繼續往上通報。

中研院P3實驗室出現確診個案，和P3同等級的北市昆明實驗室，更要繃緊神經，台北市長柯文哲就是要親眼來瞧一瞧，每個環節都不能放過，對於中研院操作病毒的高風險場域竟然出現破口，他認為根本不是像指揮中心所說，是老鼠惹的禍，台北市長柯文哲說：「到現在為止新冠肺炎感染了兩億五千多萬，然後說有三例是水貂傳人有可能啊，但是你為什麼不猜那個機率比較高的，不要先講萬一一萬都不處理，處理萬一。」

中央要全面清查，所有P3實驗室的SOP流程，但柯文哲直指相關人員欠缺訓練，SOP可能有很大的問題，台北市長柯文哲說：「P3實驗室是處理新冠肺炎，那個人員的教育訓練要做好，做這個工作一有症狀馬上就攔住的話，我就不用整天在想說天啊，到底發生什麼事去畫匡列的人。」

SOP流程到底出了什麼問題，根據了解女助理研究員，10月中被實驗老鼠咬傷後，的確有按照流程通報實驗室主管，但接下來整個流程就此卡住，直到染疫事件爆發，中央研究院學術及儀器事務處處長李建璋說：「大概在第一階段就斷鏈了，他們就是只有報到現在我們知道的，就只有報到P3實驗室的長官。」按照標準作業流程，至少有三關以上需要通報，卻在第一關就卡住根本沒有通報到院本部，除了要找出染疫源頭，更要全面檢討漏洞，確保實驗室不要再成為防疫破口！