墾丁梅花鹿近年來復育有成，雖然帶進觀光財，但也帶來新的衝擊。過去發生過多次民眾騎車、開車撞上鹿，或是農作物被啃食侵害，為了控制鹿群數量，目前研擬朝向研發鹿肉乾等副產品，不過一切都還在商討評估中，此外，也可靠疫苗來節育控制，打了針，就可以讓母鹿維持一到三年不懷孕，另外也透過跨單位合作，架設圍籬、將鹿引回復育區，來控制族群數量成長，減少人鹿衝突。

圓滾滾大眼，嘴巴不停動呀動，小鹿們吃草的模樣，格外可愛，復育區裡頭，鹿群們在大草原盡情奔跑，到哪都能看見鹿的景象，凸顯墾丁梅花鹿近年來復育有成，但也衍生新的衝擊，開車開到一半，左前方突然蹦出一隻鹿兒，駕駛來不及反應，碰一聲當場撞上，民眾說：「梅花鹿當場死亡。」

重機騎士倒地受傷，衝撞機車的鹿，沒了呼吸心跳，就怕火龍果遭啃食侵害，一個個被戴套保護，威脅農民心血的正是鹿群，從最初瀕臨絕種的100多隻，繁衍到如今近2千隻，人鹿衝突不斷，有學術單位就指出當務之急，就是要減緩族群成長速度，國立屏東科技大學野保所教授裴家騏說：「現在正在嘗試的是多年期的免疫避孕法，如果一隻鹿打一劑疫苗，在疫苗有效時間內，牠是不懷孕的。」

墾管處副處長許書國說：「如果復育區數量無法容納時，也會協調畜試所收容部分鹿隻。」除了疫苗節育控制，畜試所也延擬要研發鹿肉乾等副產品，不過一切都還在商討評估，墾管處跨單位合作，影響生態較嚴重區域，加強圍籬等措施，並提供農業災損補助，減少衝突，設法讓人鹿可以和諧共生。