中央流行疫情指揮中心11日下午宣布，全國疫情警戒升到第二級，戶外活動限制500人以下，室內不能超過100人，但有民眾發現，宣布升級後，彰化鹿港天后宮還有1萬多人的進香團，進廟裡參拜，明顯超過限制人數，認為當下疫情嚴峻，宮廟還群聚遶境，民眾都擔心會有傳染風險。

彰化鹿港天后宮，好熱鬧，來自社頭的「枋橋頭72庄進香團」，超過100個陣頭50個神轎，連番上陣，進廟裡向媽祖參拜，進香團隊伍龐大，約有一萬五千人，鹿港小鎮人群聚集，但11日下午中央流行疫情指揮中心就宣布，全台疫情警戒升到第2級，戶外活動不能超過500人，室內不能超過100人，為何上萬人的進香團，還在遶境進香，民眾說：「不應該而且很可怕，這麼多人聚集在一起。」民眾說：「擔心疫情傳染。」民眾說：「讓疫情會有增加的風險。」

彰化民政處解釋，枋橋頭72庄進香團，11日清晨六點多就出發遶境，走到下午才接到警戒第二級通知，當下趕緊派人追上進香團，加強防疫，彰化縣民政處副處長邱錦模說：「我們又當場又馬上送了，酒精噴液跟一千個口罩，趕到現場去。」

民政處也強調防疫升級，各宮廟的活動都要求暫緩或縮小規模，雲林的「六房媽過爐」，每年吸引數萬名全國信徒參加，今年也要簡化儀式了，中華民國六房媽祖會理事長徐萬成說：「聽中央的指示，要管控500人以下，有臂章的人，才能夠出入。」

去年就因為疫情的關係，取消遶境簡化儀式過爐照常舉行，今年疫情升溫，廟方也決定不遶境了，中華民國六房媽祖會理事長徐萬成說：「確認是用移駕的方式，但是沒有遶境。」

雲林六房媽，是全國唯一沒有固定廟宇的媽祖，每年都會換宮廟供奉，特殊的民俗，被列為國家重要民俗活動，卻因為新冠病毒疫情，百年來年年遶境祈福的習俗，也被迫連停兩年。