確診後康復，很多人卻反而留下後遺症。台北市約有5%-20%的新冠確診者，康復後仍然有長期後遺症，像是咳嗽、呼吸急促、嗅覺異常，甚至是心理上的壓力，因為曾長時間被隔離，容易有創傷後壓力症候群，反而更難痊癒。因此台北市7月14日開始，特別在台北榮總、聯合醫院等一共四家醫院，成立新冠長期追蹤特別門診，整合胸腔內科、精神心理科等等，要幫助這些康復者回復正常生活。

染疫康復後的後遺症包含頭痛、憂鬱、健忘、呼吸急促、嗅味覺持續異常，還有咳嗽等症狀，對這些康復者來說，只是不再具有病毒的傳染力，對身體卻已是大大損傷。確診康復者林彥汝說：「我是輕症的關係，所以我目前沒有感覺到這個病毒對我身體有留下什麼問題，像是我公公曾經有一天，他就是整個晚上都在咳嗽，醫生說這就是因為有後遺症的關係，因為他的肺纖維化恢復得比較慢。」彥汝也談到，除了生理上的後遺症，心理上才是最難治癒。

台北市為了幫助這些確診康復者，在台北榮總、台大醫院、北醫附醫、聯合醫院四間醫院，成立新冠長期追蹤特別門診，其中又以這類型的後遺症最多。北榮醫務企管部主任李偉強說：「最常出現一般還是有關情緒方面一些不穩定，甚至家人也得了這樣的問題的時候，有時候會有一些創傷後症候群，這些症候群表現症狀，就是我剛剛前面提到的焦慮失眠。」李偉強透露，長期追蹤門診必須跨部門診合，從胸前內科、復健科、再到精神心理科，有的康復者甚至要花半年才能讓身心回復到平穩狀態，也許大家多多的關懷、少一分的異樣眼光，能讓這些康復者多一分支持的力量。