美國豬肉從元旦開始開放進口，政府為了讓資訊透明，製作了豬肉儀表板，讓民眾一次可以看清楚台灣豬和進口豬的數量，但是現在食藥署的「邊境查驗自動化管理系統」出現了5批進口豬肉，和「豬肉儀表板」不同調、不相符，超過108噸。對此，食藥署回應，豬肉儀表板是已經流入市面的數量，邊境查驗自動化系統是在邊境查驗合格的數量，尚未流入市面。

兩個系統進口數不符？ 食藥署這樣解釋

根據豬肉儀表板的資料顯示，從1月1日到1月7日，只有從加拿大、丹麥和西班牙進口的豬肉，但是邊境管理系統卻看到1/4已經有5批美豬相關產品，包含「冷凍豬肉」、「冷凍豬腸」、「義式豬肉餡」、「豬肉香料 X520201U」和「豬肉餡」，大約有108噸左右，被發現後政府遭批評「資訊不透明」。

對此，食藥署表示，「邊境查驗自動化系統」是在邊境查驗合格的數量，不過其他部會相關作業尚未完成，所有部會都完成作業後，海關才會放行。海關尚未放行，代表尚未真正流入國內市場，也就未呈現在「豬肉儀表板」上。儀表板上所顯示的事已經被海關放行的進口豬肉數量，且真正流入國內市面的數量，對民眾採買才具有參考性。