國內出現第一起英國變種病毒案例(案792)，因此指揮中心也加強了邊境管控機制，從2021年1月1日起除非有特殊狀況，非本國籍旅客暫緩入境；1月15日起本國籍旅客除了以前要求的登機前的檢測陰性外，現在還更嚴格要求居家檢疫相關措施。

非本國籍禁入境 本國籍要用「升級版居家檢疫」

指揮中心指揮官陳時中表示，英國最早發現變種病毒，並不代表病毒源自於英國，還需要進一步的調查，但是現在歐、亞、非都發現蹤跡，所以指揮中心也決定要實施更嚴格的管控。

陳時中表示，這次的措施分為兩部分，一個是本國籍，另一個是非本國籍。非本國籍的部分，2021年1月1日起非本國籍的旅客暫緩入境，除非有特殊狀況，包括商務履約、外交人員、配偶和未成年子女等等。本國籍的部分則是居家檢疫變嚴格，陳時中說，1月15日起開始升級版的居家檢疫/隔離，除了原本要求的以外，現在規定居家檢疫，一戶只能住一個人，意思就是居家檢疫的地點，只能住居家檢疫者，家人朋友都不能同住，非居家檢疫者不能在裡面。陳時中解釋，主要是希望大家都可以居住在防疫旅館來集中檢疫，在社區當中構築一個比較堅強的防線。