為了西區門戶計畫，台北市長柯文哲在2016年提前終止國光客運A、B站的合約，建築隨後拆遷，國光客運向台北高等行政法院提行政訴訟，北巿府敗訴，必須核發B建物的補償費3228萬元，柯文哲表示，要請專案小組處理，決定要上訴或是和解。 怪手拆下招牌，為了台北市政府的西區門戶計畫，2016年台北車站國光客運西站走入歷史，法院判決北巿府必須核發國光客運B棟的補償費3228萬元。記者VS.台北市長柯文哲說：「(你覺得這個判決對你有不公平嗎)，不是什麼公平不公平，法律法令判下來我們就要決定，第一要不要上訴第二如果不上訴，那要和解要和解要怎麼處理。」 柯文哲說當時契約不是他訂的，但會請專案小組來處理，國光客運站換了位置營運，也向巿府申請補償，被拒絕後提告。國光客運總經理吳忠錫說：「B棟這個當時還是跟政府機關標售，給我們收了一億六千萬，今天怎麼一毛錢政府都不給予，這是我們一再跟法院來做說明的。」 國光客運總經理吳忠錫說：「單單這個西站搬遷對國光的影響，實質的損失大概就有兩三億，無形的損失那是更大啦。」 針對後續市府會提上訴或是和解，國光客運表示都會討論因應，就盼爭取到合理合情合法的補償。