中國DeepSeek橫空出世後，資安疑慮引起外界關注。行政院長卓榮泰已經要求，公務機關必須全面禁用。

數發部則指出，公立大學或研究機構如果有使用需求，得依照程序報准核可，並採取必要的管制措施才能使用。而且必須遵守三項規定，包括只有指定的特定區域和特定人員可以使用、使用理由消失後應該立即停用，同時必須以不包含個資跟資料的電腦下載，並且斷網使用。