隨著指揮中心解編之後，疾管署舉行「COVID-19感恩表揚晚會」，並由總統蔡英文親自頒獎，不過桃園市空服員職業工會、機師工會接連拒絕出席，認為機組員在疫情期間，承受的污名和被剝奪的人權，「不能用頒獎來抵銷」，對此前指揮中心指揮官陳時中表示，應該要多溝通，王必勝則再次感謝機組員貢獻。

拿著英文字母字卡，象徵挺過艱困疫情，總統蔡英文，出席COVID-19，捐贈感恩授獎表揚晚會，先為1.9萬名逝世者默哀，再感謝各行各業會防疫的付出，總統蔡英文說：「在整個過程中，要感謝的人實在是太多了，台灣有你們真好。」前行政院長蘇貞昌說：「台灣挺下來了，而且被稱為是亂世中的福地，還拚出最好的成績。」

疫情間不可或缺的角色，幾乎都來了，總算卸下3年多來的防疫重擔，2位前後任指揮官，內心更是百感交集，前指揮官陳時中說：「1197天確實是一個很長很長的日子，其實回想起來有2年，在5月這個時間，是我們特別辛苦的時候，當然我本來也很希望能夠，是我來宣布把口罩拿下來。」前指揮官王必勝說：「常常有人在問我，防疫工作在做什麼，最簡單的說法就是，陳時中叫大家戴口罩，我叫大家脫口罩，我們完成任務了謝謝大家。」

但可不是每個人，都願意再回想這段過往，有兩個單位拒絕出席表揚大會，桃園市空服員職業工會，和機師工會婉拒現身，表示「不願意當指揮中心的背板」，疫情期間承受的汙名，更不能用頒獎抵銷，前指揮官王必勝說：「機師跟空服員，他的職業特殊性，在防疫上面，因為在邊境管制上，角色比較特殊，我想也受了很多委屈。」

另一頭，副總統賴清德分進合擊，出席感恩護理師的公益演唱會，感謝護理人員守住人民健康，隨著疫情穩定，指揮中心解編，國人揮別戴口罩的日子，展開新生活，但對有些人而言，疫情間遭受的委屈，很難說忘就忘。