太魯閣號重大事故，也讓台鐵公司化的聲浪再起！包括歷任交通部長和部分學者，都認為台鐵勢必要朝向公司化改革，才能提升整體效能，但台鐵工會仍然持反對態度，認為這時候談公司化，是在打擊員工士氣，台鐵許多問題，不必等公司化，就可以開始改善。

一瞬間的意外，成為心中永遠的遺憾，從普悠瑪翻車，到太魯閣事故，經過兩年多的時間，台鐵公司化，又再度被視為改革的解方，交通部長林佳龍說：「龐大的投資，還有過去它(台鐵)的虧損，那你都要幫它解決嘛，尤其是有些政策性的補貼，不應該算到台鐵的帳上嘛。」

請辭後交通部長林佳龍，還是呼籲台鐵必須公司化，大刀闊斧的改革，但台鐵工會卻認為，事故發生後又提公司化，只是在打擊員工士氣，台鐵產業工會理事長王傑說：「公司化就能夠解決問題嗎，即使我們目前現職人員的待遇不變，那將來進來的台鐵員工呢，他也許待遇更差，更多業績上的壓力，然後其實是生活得更辛苦。」

工會認為公司化，就是讓財團染指國家土地，擔心新進員工待遇更差，也強調並不是改革的唯一手段，但交通部研擬的方向，認為可以讓資產活化，提升台鐵效能，也讓營運財務更健全，逢甲大學運輸與物流學系教授葉名山說：「工作的環境他的文化，他的(人才)流失大概20%幾到30%之間，也就是說國家考試是非常困難的，可是考進去的人你留不住。」

事實上歷任交通部長，不論藍綠執政對於台鐵公司化，似乎都持正面態度，從葉匡時主張推動台鐵企業化，到賀陳旦呼籲台鐵公司化，也呼籲應該調漲票價，林佳龍更點出公司化的關鍵，需要政府整體來推動的決心，不幸的太魯閣號事故，能不能成為台鐵改革的契機，攸關民眾的生命財產安全。