九合一大選後，新的地方首長上任，可能形成部分地方與中央政府對兩岸政策「不同調」的情況。一份最新民調顯示，有將近半數民眾認為，在這樣的情況下，地方政府還是應該持續進行兩岸交流。調查也顯示，47%的民眾認為，未來一年兩岸關係發展，和現況不會有太大的差別，另外有三成受訪者認為，中國對台灣最不友善的行為是「阻撓我國與其他國家建交和出席國際會議」，還有26%民眾認為，中國不斷進行軍演還有對台灣的各種軍事威脅，也相當不友善。