教育部長吳茂昆29日向行政院請辭獲准，上午立法院教育委員會仍繼續處理主管預算凍結案，教育部由政務次長姚立德代理部長，立委陳學聖接著就問如何處理台大校長案，姚立德表示目前全權代理部長，並照既有決定處理。 教育部長吳茂昆請辭，由次長姚立德代理，一早到立法院參加教育委員會，但國民黨立委陳學聖質疑次長身分，又問台大校長管中閔的案子要怎麼解決，姚立德先是愣住接著重複回答：「照程序處理。」部長突然請辭次長似乎也措手不及，陳學聖突然其來的問題還一度引起朝野兩黨立委爭執。 台大校長一直無法正式上任，台大學生也等不了了，準備在31日發動首波法律救濟行動，向行政院提起訴願，要求撤銷原駁回處分，和教育部應聘任管中閔教授為台大校長，台大校長遴選風波走了兩個教育部長，大家都在看「到底接下來要怎麼解決」。