延宕多年的嘉義縣故宮南院的籌建計劃又出現變數，代出將轉型成為花卉文化博物館，嘉義縣長陳明文馬上來反對，要求馬英九總統履行競選承諾。

　　二○○五年進行熱鬧的動土典禮，原本故宮南院預計在民國一百年就該完工啟用，還請來美國知名的建築師普列達克來設計，只是沒想到故宮五年來換了四個院長，一再變更設計圖，讓建築師氣得退出，還打算控告故宮，只是一波未平一波又起，現在隨著政權移轉，政策也跟著大轉彎，故宮院長周功鑫宣布要將故宮南院改為花卉文化博物館，連行政院都拍板定案，這讓嘉義縣長陳明文沒辦法接受。

　　而立委張花冠也痛批行政院，根本就沒和地方協調好就定案，根本是以北部高級外省人的角度在處理這件事。故宮南院從要不要成立、建築發包，一直以來是爭議聲不斷，連基本的定位也搖擺不定，從亞洲文物館到中途傳出要變為西遊記主題樂園，到現在的花卉博物館，民間期待南院多年，在週邊的建設投資，可能因此跟著泡湯。